细菌基因组测序
新一代高通量测序技术大大减少了基因组测序的成本和时间，让更多实验室可以开展微生物基因组测序项目。根据不同的研究目的和测序要求，细菌基因组测序可分为四种类型：细菌基因组Scanning、细菌基因组
基因组重测序（Re-sequencing）
使用的Illumina Genome Analyzer平台只需要极少量的样品，便可对数量有限的保存组织、拟胚体、小的模式系统和难以培养的生物进行测序。
ChIP-seq
提供全套的ChIP-seq服务，将ChIP与第二代测序技术相结合，以高效率的测序手段得到高通量的数据结果，从而获得在全基因组范围内与特异性修饰组蛋白和转录因子等结合的DNA区段信息。
宏基因组测序
宏基因组测序是指对样品中所有微生物基因组DNA片段化后进行高通量测序，进行序列组装和基因注释，获得部分不可纯培养微生物的基因组序列，分析该环境下所有微生物基因集信息。
Solexa高通量测序服务
Illumina公司新一代DNA高通量测序仪Genome Analyzer采用核心专利技术“DNA簇”和“可逆性末端终止”，具有高准确性、高通量、高灵敏性和低运行成本等优势。
微生物Meta测序
16S rDNA序列（在所用物种中高度保守）是最常用的细菌分类标准，通过提取环境样品的DNA，并扩增其中16S rDNA基因；通过检测16S rDNA 的序列变异和丰度，反映环境样本中细菌的分类和丰度
Solid 4二代测序
SOLiD 4是由ABI公司研发的新一代超高通量基因测序分析系统。该系统采用结合在磁珠上单分子DNA片段簇为测序模板，以四色荧光标记寡核苷酸进行连续的连接反应为基础，对扩增的DNA片段进行大规模高通量测序。
外显子捕获测序服务
外显子组序列捕获及第二代测序是一种新型的基因组分析技术：外显子序列捕获芯片（或溶液）可在同一张芯片上以高特异性和高覆盖率捕获研究者感兴趣的目标外显子区域。